建有农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室、农业部冷库及制冷设备质量监督检验测试中心、农业部水产动植物病原库、另有农业部远洋渔业培训中心、中央农业干部教育培训中心上海水产大学分院和农业部渔政管理干部上海培训中心以及由中国鱼类学重要奠基人、著名鱼类学家、一级教授朱元鼎先生创建的鱼类研究室和标本室、中日合作淡水渔业资源高度加工利用研究室、捕捞模拟、航海雷达模拟、以及“全球海上搜救和安全系统（GMDSS）摸拟、资源环境遥感、淡水渔业资源利用等特色实验室。

目前，上海水产大学在校本专科学生12856人，独立二级学院学生2588人；硕士生424人，博士生46人，成教学院学历教育学生为1100余人，折合学生当量数为304人，另每年接受近4000人次的继续教育培训。 

上海水产大学占地面积518518.29平方米，教学行政用房总面积157707.68平方米,体育场地总面积47865.00平方米。学校拥有单价800元以上的教学仪器设备总值9778余万元，图书馆藏有以水产、海洋、食品为特色的纸质图书68.54万册，电子书籍36万册，建有千兆主干、百兆交换到桌面的校园网络，和服务于学校以及水产行业的“上海水产大学”、“中国水产网”两个互联网站平台，学校承办的《水产学报》、主办的《上海水产大学学报》被三大主要检索机构列为中文核心期刊、中国科技核心期刊和中国科技论文统计源期刊，《水产学报》获第一、二届“百种中国杰出学术期刊”称号。 

上海水产大学最早在全国设立了水产品加工、罐头制造、水产品综合利用、工业捕鱼、海洋渔业、渔业资源、渔具力学、渔业机械、渔业电子，淡水渔业与管理、海水养殖、鱼类学，渔业经济等专业。率先在全国开设的课程、编著的教材有：渔具理论与计算一般原理、渔具力学、声光电渔法，渔业资源生物学、渔业资源评估，鱼类学、鱼病学、水产增养殖学、鱼类生理学、藻类学，国际渔业、渔业经济学、冷藏工艺学、助渔导航仪器等。

学校在鱼类学、水产增养殖、水产动物种质资源、水产动植物病害防治、水产动植物苗种、水产动物生物技术、海洋生态、水生生物、水域环境、海洋渔业科学与技术、渔业工程、渔业资源、渔业管理、渔业经济、水产品加工与贮藏工程、食品科学与工程、制冷与低温工程、机械工程、渔业法规与政策、渔业经济等领域取得明显优势。1978年以来共获得数百项研究成果和数十项专利技术，其中100多项获国家和省部级科研成果奖，产生显著的经济和社会效益。

上海水产大学在产学研相结合、教学改革与实践、大学生素质教育等方面获得多项教学成果奖，其中“海洋渔业专业的教学改革和实践”（主持）获1997年国家级教学成果一等奖，“海洋渔业科学与技术人才培养模式研究及教学改革实践”（主持）、“普通高等农林院校教学工作评价研究与实践”（参与）获2001年国家级教学成果二等奖。近年来，学校连续多次被中宣部、教育部、团中央评为“大学生暑期社会实践先进单位”。